Возможно что диск сильно фрагментирован, в этом случае поможет дефрагментация:
Щелчок правой кнопкой по диску -> Свойства -> Инструменты -> Дефрагментация
Еще долго копироваться может больше количество маленьких файлов, с этим ничего не поделать, кроме как купить SSD винчестер.